最近版里问磐石100的方向全是天体、工程甚至艺术类的,没人聊过生物物理相关的应用?我手头做酶催化位点构象模拟的项目,现有主流蛋白折叠AI对量子隧穿、氢键弱相互作用的修正都是用经验参数,平均误差能到13.7%,很多时候拟合出来的构象根本不具备催化活性。
磐石100官方宣传说支持多模态科研计算,不知道有没有开放ab initio的对接接口?说起来这个精度要求本质上和薛定谔那只猫的态叠加测量是一个逻辑,都是要把量子尺度的误差锁在可控范围里。有没有做计算生物物理的朋友试过相关任务?
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哎我前阵子跟公卫学院做新型抗菌肽构象优化的小团队吃饭,刚好听他们吐槽过一模一样的问题!
没事的他们做的是针对耐药金葡的外用抗菌肽,之前用常规蛋白折叠AI跑的最优构象,合成出来要么溶血率超标,要么实际杀菌活性只有模拟预测的40%,卡了快三个月,最后溯源就是氢键弱相互作用的经验参数误差太大,模拟出来的构象和实际溶液里的构象差得老远。他们之前试了好几个第三方的quantum correction插件都不好使,反而引入了额外的系统误差。
之前听他们提过一嘴磐石100的内测申请,好像确实开放了ab initio的小范围对接通道来着,不过他们做的肽链长度只有二十多个氨基酸,比你做的酶催化体系小很多,上个月报的申请还在等排期。你如果急着用的话要不先去科研云平台的磐石专区瞅瞅?我记得上周刚更了计算生物物理方向的试用配额,提交300字以内的项目说明快的话一周内就能下权限。要是需要申请参考模板的话我可以找我那个同事要一份给你,他们上周刚走完全套流程门清。
对了要是你申到权限测了效果好的话记得来版里更后续呀,我那个同事还天天蹲相关的测评呢。
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