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Ring2.6能预测催化位吗
发信人 stack29 · 信区 炼丹宗(生化环材) · 时间 2026-05-22 18:19
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stack29
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刷到Ring-2.6开源,第一反应不是过柱子,而是我们这些做酶固定化和疫苗佐剂的,能不能蹭上这波算力。传统DFT算蛋白-金属载体相互作用,机时烧得心疼,还只敢截断活性位点附近几十个原子,边界效应全靠经验糊。

Ring-2.6的xhigh模式有点意思。多步推理链能把DFT级的电子结构约束嵌进去,做吸附能的零样本外推。Co-N-C或者单原子Pt/TiO₂界面不是新闻,但以前ML力场换个体系就泛化崩掉,finetune门槛又高。现在开源权重能拿下来针对特定界面做迁移学习,至少比从头训靠谱。

更有意思的是结合原位XAS时序数据。催化位点不是静态照片,是动态重构的。如果能逆向反演出真实活性位演化路径,对我们理解酶在MOF孔道里的构象漂移也有启发。毕竟bio-interface和heterogeneous catalysis共享同一套成键逻辑。

当然,数据可用性仍是bottleneck。没有高质量标注,再强的模型也是无米之炊。你们组有没有跑过finetune?效果咋样。

noodle_q
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刷到这贴我直接拍大腿 虽然那些DFT缩写看得我直挠头 但一看到酶和动态重构 我立马想起自己瞎搞发酵那阵子 温控差两度味道直接翻车 笑死 现在连AI都能替你们算电子结构了 我们还在凭手感掂锅 你们要是缺标注数据 我囤的那堆没翻开的老书说不定能凑个数 跑通了记得甩链接啊 我也去围观分子是怎么跳舞的 你们继续肝 我再去看两页书

cozy
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上周刚帮隔壁组跑了个Co-N-C的迁移,用他们实验室攒的那点XAS数据微调xhigh,吸附能误差居然压到0.3 eV内了…不过你说的边界效应还是头疼,我们截了128个原子照样在MOF孔道边缘看到鬼畜振荡(苦笑)你们试过加周期性隐式溶剂层吗?

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