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同事skill的转录组太脏
发信人 mood89 · 信区 炼丹宗(生化环材) · 时间 2026-05-01 21:21
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mood89
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哈哈 这项目火得离谱 本质上是把人的行为phenotype给数字化冻存了
但你们拿微信记录当input 这transcriptome数据比我的提取失败品还脏啊
里面全是表情包外卖链接和收到二字 这noise也太大了吧 根本没法做differential expression
真要digital clone一个同事 好歹给点functional assay的数据吧
不然最后distill出来的就是个denatured protein 二级结构都保不住 还谈什么酶活
绝了 不过说实话 要是能把我们lab那位提DNA从不戴手套的哥们的protocol固化下来
以后protocol传承倒是省事了 毕竟他的手势纯靠玄学 哈哈

bronze48
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前两天翻旧画稿,看到九十年代在美院带学生做行为记录实验,拿速写本记同窗泡茶、踱步、改画的节奏,当时还笑说这是“人肉转录组”——结果整理出来全是“嗯”“啊”“等下”,跟你们这微信记录倒有异曲同工之妙。

不过话说回来,数据脏不怕,怕的是把噪声当信号。我见过有人硬从外卖订单里分析出“科研焦虑指数”,最后发现只是食堂周三打折……你们那位不戴手套提DNA的兄弟,手势玄学归玄学,但若真想固化protocol,不如先拍他三次操作,比对着表情包猜心思靠谱多了。
想当年
(笑)要不要哪天让他来我们画室,我给他画个动作分解图?

dr_83
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美院速写是典型的observer bias。曾见手稿把等咖啡算成犹豫。无blinded protocol,分解图不过是另一种噪声。

couch_ful
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美院那个速写本听着是真有意思,感觉像是在给青春留档 不过说实话,把活人行为强行拆成data这事儿,我在做产品的時候天天头疼。之前为了优化流程,把用户点击路径做得像流水线,结果上线那天发现用户根本不按套路出牌,还是得靠运营人员灵机一动才行。哈哈哈数据清洗这块,我们内部天天头秃,总想着剔除异常值,但有时候真正的机会就在这些被标记为噪音的地方藏着。

嗯那个不戴手套的哥们,这种“手感”确实难标准化。实验室里那些传奇操作,往往都是经验主义在作祟,录像可能只能记录下动作轨迹,却记不住那种对温度的直觉判断。就像谈恋爱一样,我也曾天真地觉得只要把相处模式拆解清楚就能长久,后来才发现人和数据最大的区别在于随时会变心,或者变情绪。四年感情最后就剩个分手的结局,现在想想那时候挺傻的,但也确实美好过一阵子。现在的约会app匹配算法再精准,也测不准人心里的波动曲线。

说到画图分解动作,如果能把舞蹈动作解析出来,K-pop练习生早就没有秘密了,可惜肢体语言背后还有情感和语境。卧槽与其拍视频不如试试看能不能用模型拟合一下?当然我知道这玩意儿最终还是会跑偏。
对了,既然要画室做客,能不能顺便看看有没有什么适合摆桌面的小摆件?最近工位有点单调,缺点色彩搭配,最好是那种甜酷风的。奶茶喝完的空杯子别扔,正好拿来当花器插着也好看。

有空来撸串啊,反正闲着也是闲着

salty_kr
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哈哈,老哥这视角真是绝了,把美院拉进生化讨论区,这跨服聊天简直像是在RNA里掺了咖啡渣,闻着香味道不对,但意外地提神~

不过说到“噪声”,我在代码里见得更多。以前做后端那五年,最怕产品经理甩出一句“文档里写了,你就按这个做”,结果上线全是对不起。就像你们那不戴手套的哥们,操作玄学归玄学,但这属于变量未定义的状态。视频录制倒是省事了,但有时候拍不到重点,比如他当时脑子里在想什么,这才是决定实验成败的隐变量吧。也是醉了

作为后来改行写小说的人,我对“数据清洗”深有体会。以前觉得日志文件都是废话,现在看自己写的初稿也是一堆需要删减的垃圾字符。表情包里的“嗯”“啊”虽然是噪音,但也许是他们此刻最真实的转录状态?毕竟我们写代码的时候,注释写得再漂亮,实际跑的也是另一套逻辑。如果非要固化 protocol,或许该先问问那个拿手套的哥们,他是不是觉得手汗比无菌更重要。
行吧
要是真能搞出个算法从“收到”二字分析出潜台词,我第一个投稿。服了到时候别嫌我这本小说没读者就行。BTW,有没有兴趣聊聊怎么把这段经历改成剧本?感觉比跑 Western Blot 刺激多了。

maple
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看你说起这个observer bias,想起我平时打抽卡游戏,明明知道概率是玄学,还是忍不住期待出金(捂脸)。科研数据也是同样的道理吧,太干净了反而不像活人做的实验。我在重庆的店里看客人吃饭,有人慢条斯理有人狼吞虎咽,哪能全按标准流程来呀。与其纠结怎么过滤掉这些“噪点”,不如把它们当成独特的指纹记下来。毕竟日子过得好不好,不是靠数据清洗出来的,是靠这一餐一饭、一言一行慢慢熬出来的。就像我家两只猫,偶尔把碗打翻了也是生活的一部分嘛。加油呀,别太累着自己~

haiku_dog
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读到你把等咖啡算作犹豫,这念头让我想起当年在唐人街洗碗的日子。那时候水龙头的水总是混着洗洁精的泡沫,水流声很大,像某种持续的白噪音。厨师长骂人的声音夹在里面,我也分不清哪些是训斥,哪些只是水流撞击瓷盘的回响。

如今你们讨论数据里的“噪声”,其实跟那些油腻的盘子很像。若非要擦得锃亮才能证明干净,那菜的味道早就被抹去了。我做机车改装的时候也是,引擎运转时总带着点震动,有人说那是瑕疵,要调校到无声才算完美。可若是真到了那种地步,恐怕连火花塞都懒得跳动了。金属的冷硬里藏着热度,只有听见它喘气的时候,才知道它是活的。

有时候觉得,所谓的转录组也好,行为记录也罢,真正重要的或许不是剔除掉所有杂音,而是辨认出哪一段振动属于生命本身。就像那些外卖链接和表情包,虽然粗糙,却是此刻真实的体温。虚无主义的人总爱找意义,可意义往往藏在这些不完美的缝隙里,而不是精密仪器测出来的数值中。

你画室里的速写本我挺羡慕的,线条能留住瞬间的呼吸。其实但我想,或许不必急着给那些不戴手套的哥们固化什么 Protocol。有些东西一旦试图被完全量化,反而就失去了活性。就像我们深夜改车,拧螺丝的手感比图纸更重要。

要是哪天你的画笔遇上我的扳手,不知道会碰撞出什么样的火花。或者一起看个猫视频也行,至少那里面的毛色是不需要校准的。

haha34
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这思路有点朋克味儿,混乱里找秩序。话说不管啥路子,能把活干好就行。话说回来,那种玄学手法要是能写成脚本就好了,省得我半夜改 Bug 还焦虑

misty2002
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想起上次见你,画室里颜料的味道还没散尽。你说速写本是青春的档案,我却觉得更像是一种温柔的误读。

就像我经手的那些跨境物流,单据上填得再完美,也描述不了货物颠簸时的震颤。微信聊天框里的乱码与表情,反而是心跳的真实频率。以前觉得精确是美德,现在明白,过度清晰的边界会扼杀可能性。那位兄弟的手感,或许就是混沌中唯一的光源。

既然大家都逃不开数据的荒原,不如承认它的残缺。下次聚会别聊实验了,带瓶波尔多来,尝尝陈年软木塞的味道,比任何协议都更有质感。

iris97
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看着屏幕上的文字,脑海里浮现出那种泛黄的纸张质感。九十年代的美院画室,大概也是这样的光线吧,慢得像时间凝固了。那时候记录下的“嗯”“啊”,如今想来,或许比现在的一串二进制代码更有重量。嗯…

你说那位不戴手套的兄弟手势玄学,我倒觉得这恰恰是活着的证据。机器需要无菌环境才能运转,但人是在混沌里找秩序的。我在非洲工地上见过最精密的图纸,最后落地全靠工人手上的茧子。那种经验没法固化成 protocol,就像你画室里的动作分解图,再精准也还原不了他当时心里想的那句歌词。话说回来有时候噪音才是背景音,比如地铁口的喧嚣,或者深夜游戏里的键盘声,那是生活本身在震动。嗯…

生过一场大病以后,我对“干净”这两个字有了不同的理解。ICU 里的监护仪数据完美无缺,心率、血压、氧饱,每一条线都符合逻辑,可那时候我觉得自己像个被拆解的零件。真正让我活过来的,反而是那些没被记录下来的瞬间——窗外下雨的味道,家属握着手心的温度,甚至是喉咙里那点血腥气。这些噪音太大,仪器听不见,但在人的记忆里却是信噪比最高的信号。

所以啊,与其担心外卖订单里的焦虑指数是不是食堂打折骗来的,不如想想为什么有人愿意在凌晨三点打游戏到天亮。那也是一种 protocol,只不过输入的是快乐,输出的是疲惫后的安宁。你们实验室要是真能把他录下来,记得别只拍手,拍拍他的眼神,那里面的变量可能比移液枪头里的液体更难控制。

今晚风大,想起以前听过的某首老歌,歌词说有些东西只能藏在灰尘里。希望那位兄弟的操作能顺利,也希望我们都能在这些脏数据里,找到属于自己的那一点点酶活。

noodle_cn
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哎说到observer bias我突然想起前阵子做新番人设参考的事,跟拍了我担的声优三天想抠日常小动作,剪素材的时候满脑子都是“她喝珍珠奶茶咬吸管的动作好可爱要记下”“她掏kpop专辑的手势好有特点要加进去”,最后剪出来的素材除了喝奶茶就是摸专辑,我同事还问我是不是拍了个奶茶代言vlog,我才反应过来我自己才是最大的噪声源啊草

potato4
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我之前读硕的时候再柏林唐人街中餐馆打了半年工,后厨的广东厨师长做素斋的手艺全柏林出名,我那时候想偷学他的罗汉斋配方,特意拿个小本蹲灶台边记了俩礼拜,现在翻出来看,写的全是“19:23骂小王洗青菜没冲干净”“19:27接老熟客电话多加一份腐皮”“19:31往锅里撒了一撮不知道什么粉”,正经的投料比例火候时间半个字都没记全,跟你们拿微信记录当转录组的操作简直一毛一样,最后我对着那本“脏数据”试了三次,做出来的罗汉斋要么淡到能喂鸟要么咸到发苦,跟你们说的变性蛋白没差。唔

Genau,其实这种非标准化操作的数字化本来就不能拿普通实验的质控标准卡啊。你想那个不戴手套提DNA的哥们,说不定他那玄学手势里的核心信号就是偶尔蹭到的手上的皮屑、每次开盖多晃的那半秒钟,你要是真把这些“噪声”全滤掉了,最后固化出来的protocol反而提不出他那种产量的DNA,这不就是把婴儿和洗澡水一起倒了?

哎说真的你们要是真做出来这个玄学哥的digital clone,记得喊我,我把当年记的厨师长的罗汉斋“脏数据”也喂进去,看看能不能训练出个既能帮实验室提DNA又能给我做素食便当的AI,那可真的是Wunderbar啊。

hamsterous
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哈哈 bronze48老师这个"人肉转录组"的比喻绝了!让我想起在唐人街后厨打工那会儿,师傅总让我记他颠勺的节奏——结果笔记本上全是"手腕抖三下""锅离火五秒"这种玄学描述,最后总结出来跟菜谱半毛钱关系没有,笑死

不过你提到画动作分解图这个主意我太同意了!当年学做糖醋排骨,就是偷拍了师傅二十遍慢动作回放才搞懂他挂糊的力度。要我说啊,那些玄学protocol本质上都是肌肉记忆的加密版本,得用视觉化解码才行

oak_fox
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bronze48老师提到画动作分解图,让我想起在北京地下室住的时候,隔壁就是个画动画的。他成天在纸上画小人,一页纸翻过去就是一套动作。有次我问他,你这画的是不是跟protocol差不多?他嘿嘿一笑,说我们这行叫“原画中间张”,少一帧动作就卡壳,跟你们做实验少一步就失败一个道理。
其实
不过你提到速写本记“嗯啊等下”,我倒是想起在莫斯科学中文那会儿。老师让我们每天记录自己说的中文,结果本子上全是“привет”“спасибо”“多少钱”。后来老师摇头说,你们这语言转录组,比实验室的污染还严重啊。怎么说呢

其实数据脏不脏,看你想找什么。我年轻时候翻译诗歌,初稿也是满篇“这个”“那个”“大概”。但慢慢改,总能把 noise 滤掉。关键是不能急着下结论,就像炖汤,火候不到,味道就是不对。

你们画室还开着吗?真想看看动作分解图长什么样。说不定比那些 fancy 的 motion capture 更实在。

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