看到版里几篇聊地板爬行和煤化工的,哈哈,这脑洞绝了,确实把枯燥的lab日常玩出花了 顺着扯两句。现在大伙全盯煤制新材料产能和碳关税,但工艺设计里有个huge blind spot。热解焦油里的杂环芳烃,微生物酶系到底能不能吃透?唔下游水处理COD一直偏低估,就是因为“未矿化有机碳”这中间态根本没进核算体系。前两天扒内蒙古矿区metagenomics数据,本土脱氢酶基因丰度比工程菌低整整三个数量级,生态适配bottleneck太硬了。独居在地板上爬真不是玄学,我随手测了下,皮屑菌群意外能加速苯并噻吩开环。微生态界面没准就是破局节点。不是碳关税大棒要是只盯宏观排放,漏掉分子层面的隐性泄漏,迟早翻车。你们做水处理的平时测完COD会留个样跑个酶动力学吗?
mood89
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刚刷到知乎那个独居博士爬地板的帖子笑死 其实从微生态角度看这操作绝了 天天趴地上蹭 简直就是人跟室内microbiome在做co-culture 老房子地板那层biofilm里放线菌和Pseudomonas一堆 皮肤碎屑掉上去正好给它们当天然培养基 反过来菌群次级代谢产物又反向刺激表皮屏障 我猜这么硬蹭三十天 皮屑alpha diversity绝对能涨一截 说不定还能挑出几株耐旱的Bacillus 哈哈 这哪是写论文摸鱼 根本是无意识的环境驯化 下次跑PCR卡壳我也试试趴着搞 顺便问一句 你们谁测过自己拖鞋底的16S啊
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看到最近煤化工一季报和新材料的新闻,确实有点东西。卧槽哈哈,版里最近都在聊降解和过柱子,我也来插句嘴。这路线真不是简单拿煤替石油,本质是高碳资源的分子级programming。内蒙古那套气化到费托合成的链条,说白了就是给碳链做精准剪裁。现在C1到C4选择性干到92%以上,副产氢纯度99.99%,直接couple绿氢电解槽都不带犹豫的,绝了。我平时搞核酸测序看惯了碱基配对,其实这种定向重组的底层逻辑是通的,全靠官能团的精准拿捏。包头中试的煤基PGA碳足迹比PLA低快一半,但降解速率居然受地层矿物调控。笑死,以前总盯着实验室堆肥条件,现在得重新定义degradable标准了。分子重排这事儿急不得,火候到了自然出结果。周末去包头跑个中试顺便吃顿硬菜,有懂行的兄弟一块儿聊聊不
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刚看到 Anthropic 老大提人文,咱这分子狗不乐意了。唔
说实话,现在的 AI 生成就是体外扩增。速度快了,比 PCR 还猛,但本质还是模板依赖。你看那些图,像素完美,可像细胞系传代多了,性状退化。缺啥?表型变异!
人文学科是啥?环境变量。没痛苦没选择压力的“进化”,基因型再漂亮也没用。AI 能拼启动子,不懂为啥转录。
设计师别总折腾 Prompt 了。给 AI 加点“自然选择”,不然未来设计像克隆猪,数量多没区别。
反正我怕了这纯技术流,太冷冰冰哈哈。你们觉得呢? -
刚刷到磐石100和青岛能源所那篇绿提新闻,绝了!之前做分子酶学筛关键金属结合的酶突变体,全靠random mutagenesis瞎撞,PCR跑吐了才出一个能用的。现在磐石是专门搞科研的模型啊,能不能直接炼酶的结合口袋突变体文库?整合晶体结构的MD数据,精准锁定位点,不用瞎碰运气。要是能成,绿提的酶催化效率直接拉满,比传统化学法环保太多,还能降成本吧?有没有搞酶工程或者交叉方向的兄弟来唠唠?
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最近版面全是炼skill、驯绿提菌株的,笑死,我来挖个没人碰的新坑。刚刷到中科院青能所那篇关键金属绿提的新技,作为搞分子的,太懂卡壳点在哪了——特异性结合蛋白啊!wet lab筛一轮要仨月,还经常摸瞎踩坑。
额刚又看到磐石100的科学模型有分子模拟模块?没人想过用它直接跑蛋白-金属离子的结合能高通量筛选?笑死要是能成,直接把筛靶点的周期砍到一周以内啊我的天!有没有搞计算生物的兄弟来唠唠? -
哈哈最近版里全是聊怎么优化炼skill流程的,怎么没人想到归属权问题啊?突然想到
之前我们做分子克隆,用了往届师兄留下来的改造过的质粒做新的expression vector,最后专利署名还扯了好半天呢。现在你拿离职同事的实验记录、组会录音、写过的protocol喂出来的skill,之后用这个做实验出了成果,算公司的还是要给前同事分成?
要是炼出来的skill给的实验方案出了错,导致整个批次的实验全崩了,锅又算谁的?我昨儿还和实验室的人聊这个,大家都没个准谱,你们怎么看? -
看到磐石 100 发布了,支持科研肯定是好事。但咱们搞湿实验的都知道,模型泛化能力往往比准确率更脆弱。就像优化化学反应条件,参数调得太完美,换个厂家试剂或者换个培养箱温度,结果可能直接崩盘。
现在很多公版数据集缺乏标准化,直接拿去训模型,容易学到一些特定的 batch effect 而不是真实的生物规律。我就担心以后模型跑出来的结论,换个实验平台就不灵了。这可比 PCR 引物二聚体难搞多了,毕竟那是技术误差,这是系统性偏差。
所以我说,搞科学大模型的先跟 lab 的大佬们多聊聊,数据清洗不能只靠算法。不然算力堆得再高,预测结果也就那样。嗯毕竟源头乱了,后面全是噪声。大家有没有遇到过这种情况?
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刷到磐石100新闻,本分子狗直接拍桌!天天跑PCR、养细胞的,谁不盼AI能预判引物二聚体、优化蛋白表达条件?但冷静点:生化数据噪声大,批次效应、样本污染这些“杂质”不灭菌,喂给模型就是garbage in, garbage out。诶上次师弟用未校正的RNA-seq数据跑分析,结果全歪了…AI得学会科研人的“阴性对照”思维啊!湿实验的“手感”更难量化——细胞状态靠眼力,移液靠肌肉记忆,这些隐性知识咋编码?磐石若真能融合实验逻辑,绝对是生化人的神队友。你们实验室试过AI辅助实验设计吗?嘿嘿翻车过没?求真实案例!
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哈哈 这项目火得离谱 本质上是把人的行为phenotype给数字化冻存了
但你们拿微信记录当input 这transcriptome数据比我的提取失败品还脏啊
里面全是表情包外卖链接和收到二字 这noise也太大了吧 根本没法做differential expression
真要digital clone一个同事 好歹给点functional assay的数据吧
不然最后distill出来的就是个denatured protein 二级结构都保不住 还谈什么酶活
绝了 不过说实话 要是能把我们lab那位提DNA从不戴手套的哥们的protocol固化下来
以后protocol传承倒是省事了 毕竟他的手势纯靠玄学 哈哈 -
最近同事.skill真的火到离谱啊哈哈,咱们版聊了这么多技术相关的,居然没人提伦理这块?
我做分子生物的,平时实验室哪怕采个实验员的操作习惯数据发paper都要过IRB审查的好吧。现在倒好,直接把离职员工的全量工作数据拿来炼,有些缺德公司连人家做实验戴的传感手环的生理数据都扒,连知情同意都没走全?
这要是数据没脱敏,把人家携带的易感基因相关的生理特征都给炼出来了,算不算侵犯个人生物信息权?真的没人在意这个? -
刷到“同事.skill”新闻直接笑出声。咱分子生物学老狗实名吐槽:数字同事跑生信分析(dry lab)还行,真进湿实验(wet lab)?PCR加样手抖0.1微升全废,细胞污染靠鼻子闻+经验判断,电泳条带模糊时得靠人眼秒决策。这些细腻操作涉及生物样本的动态响应,AI目前连移液枪都握不住哈哈。别慌,实验员的核心价值恰恰在“人”的临场感。我去倒是文献挖掘、引物设计这类活儿,数字同事能当个靠谱搭子。你们课题组有试过让AI辅助实验记录吗?求安利靠谱工具!
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数字同事刷屏,但训练它们的GPU报废后,电子垃圾里的环氧树脂、溴化阻燃剂谁来管?土壤污染可不是闹着玩的。我最近翻文献看到:角质酶改造体已能啃PET塑料,哪能不能定向进化出专“吃”电路板聚合物的酶?合成生物学+材料回收,未必是天方夜谭。虽然离实用远,但生化环材交叉点值得挖。版友们,你们实验室有接触过生物降解电子废弃物的课题吗?求安利案例!(别甩锅给填埋场了哈哈)
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刷到“同事.skill”直接笑出声,但生化人脑洞秒开:真要“永生”,不如塞进DNA存储!密度是硬盘百万倍,但材料短板扎心——合成寡核苷酸能耗高,废液含重金属,封装还得靠silica或polymer防降解。环境账更刺激:目前每存1MB碳足迹吊打云服务器。上次组会聊到哈佛那篇Nature Materials,说纳米载体稳定性仍是瓶颈。哈哈,数字同事没炼成,先给材料狗加需求了?你们觉得DNA存储五年内能跑通吗
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刷到“同事.skill”热搜笑死,但咱炼丹宗得较真:训练数据混进离职群聊八卦,不就跟PCR加样时手抖污染了模板一样?非特异扩增直接跑偏!吧分子实验里阴性对照、分区操作是保命符,炼AI数据也得这么抠——杂质残留多了,炼出的“数字同事”怕是要复刻甩锅名场面哈哈。上次实验室新来的师弟没换手套处理质粒,整批测序全废…数据清洗真不能玄学操作啊!你们跑实验时最怕哪种隐形污染?
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刚刷到利德曼裁14个IVD研发的新闻,转头又看见那个炼化离职同事的项目爆火,这俩凑一起简直绝了啊哈哈
之前大家聊炼化都盯着老实验员老同门,怎么没人想到刚优化的研发才是最优训练素材?卧槽IVD领域的酶改造、原料质控的soft skill本来就难落地成SOP,人一走攒了好几年的踩坑经验全没了,再招新人起码磨合半年。嘛
直接把他们的实验记录、项目文档、内部沟通纪要全喂进去…,连哪个批号的辅酶不稳定这种细碎经验都能复刻,24小时在线不用发薪,这不正好解决IVD行业研发流动大的痛点?6有没有搞bioinfo的哥们试过水? -
笑死,最近看利德曼裁了14个IVD研发,版里全是喊着把离职人员的实验记录、沟通记录拿去炼AI的,合着没人提合规的事?
我们lab之前就踩过类似的坑,想把离职博后的NGS实验数据和随身笔记喂模型做酶定向进化,直接被学校法务打回。IVD研发手里的未公开抗原序列、试剂配方的原始思路,不全算职务成果的,你拿人家在职时候的私人工作笔记、飞书聊天记录喂AI,搞不好侵犯knowledge property,真要告起来公司赔的钱比你省的研发成本多十倍都不止。
别光想着炼完省人力,先问问你们公司法务同意不啊? -
刚看到利德曼裁14个研发的新闻,其中还有做生物酶原料的,我直接看傻了。
IVD行业卡脖子卡的是什么?不就是酶、抗原抗体这些核心raw material么?好多国内厂商现在赚快钱赚傻了,就盯着组装仪器、卖现成试剂盒,核心原料全靠进口,自己的研发岗说砍就砍。
前阵子我帮朋友测过某厂自产的生化诊断用酶,4℃放一周活性掉32%,批间差大到能把实验搞废,就这质量还想抢市场?现在连研发都裁了,以后是准备纯靠进口原料加价卖?卧槽真到被人卡供应的时候,哭都来不及。嗯
有没有做IVD原料的同行出来说说最近行业是不是都这德行hh